Книжная миниатюра является особым разделом коллекции рисунка, состоящим главным образом из иллюминированных рукописей позднего средневековья. Она включает 32 рукописи, охватывающие период с XII по XIX век. Особенно интересными памятниками являются французские рукописи: часослов XIV столетия, "Трактат об охоте" Фебюса де Фуа ( 1381 г.), "Роман Розы" (ок. 1500 г.) и фламандский часослов грани XV-XVI веков. Интересен итальянский молитвенник 1524 г. (свадебный подарок папы Климента VII Екатерине Медичи).
Среди отдельных листов выделяется всемирно известная сюита миниатюр некогда входившая в состав кодекса "История второй Пунической войны", исполненная флорентинцем Франческо Пезеллино (1422-1457) на пергаменте гуашью и золотом. Миниатюры этой серии большого размера (в среднем 30х20 см) отличаются изысканностью линий контура, тонкостью проработки деталей, интенсивностью цвета. Такова, например, "Аллегория Рима".
